Я так понимаю, что под словом "скин" имеется ввиду оболочка, которая облегчает установку программ. Её необходимо создавать самостоятельно с использованием какого-нибудь языка программирования, или по технологии flash. Затем, как сказал Trotil, создаётся текстовой файл с сылкой на созданную программу. При запуске диска система выполняет действия, записанные в этом файле и запускает программу.